1、客观方面不同。前者在客观方面表现为，违反国家有关医疗管理的法律、法规的规定，非法行医，情节严重的行为。后者在客观方面表现为，医务人员在合法的诊疗护理过程中，违反规章制度，严重不负责任，造成就诊人死亡或者严重损害就诊人身体健康的行为；
2、主体不同。前者的主体是不具有医生执业资格的人，而后者的主体是已经取得医生执业资格的医务人员；
3、主观方面不同。
法律依据
《中华人民共和国刑法》第三百三十五条
医疗事故罪，是指医务人员由于严重不负责任，造成就诊人死亡或者严重损害就诊人身体健康的行为。
《中华人民共和国刑法》第三百三十六条
非法行医罪，是指未取得医生执业资格的人擅自从事医疗活动，情节严重的行为。