在高考志愿填报中，如果你已经填报了三本民办院校，仍然可以选择填报专科批次的志愿。

这是因为高考录取是分批次进行的，不同批次之间互不影响。只要你达到了专科批次的录取分数线，就可以参加专科批次的志愿填报和录取过程。需要注意的是，各省份的志愿填报时间和规则可能有所不同，因此在填报专科志愿前，务必了解清楚所在省份的具体规定和要求。同时，也要根据自己的实际情况和职业规划，合理选择适合自己的院校和专业。