南山音乐学院本科和专科是相互独立的，不是在一起的。

南山音乐学院是一所独立的本科高等音乐学府，而南山艺术学校则是南山音乐学院的附设的专科学校，主要培养艺术类专科人才。两个学校分别有自己的教学体系和招生计划，学生从中选择适合自己的学习形式。