惠州市体育运动学校的收费标准为：体育专业的学费是每年3940元，住宿费是每年900元。

这是学校主要的收费信息，但具体的费用可能会根据学生的年级和宿舍类型等因素有所变动。建议在正式报名前，直接联系学校的招生办公室或者财务部门进行详细咨询，以获取最准确的费用信息。