民办专科与公办专科的主要区别在于办学主体和管理体制。

公办专科是由政府出资建立，通常享有国家财政支持，教育资源相对丰富，学费较低；而民办专科则是由社会组织或个人投资创办，自负盈亏，学费相对较高。在教学质量上，两者并无绝对优劣之分，但公办专科可能因政府背景而在某些领域拥有更多合作机会。另外，民办专科在课程设置、管理方式等方面可能更具灵活性。