南京市拥有众多知名的高等学府，其中包括南京大学、东南大学这两所“985工程”和“211工程”重点建设的综合性、研究型大学。

此外，还有南京理工大学、南京航空航天大学等理工科强校；南京师范大学、南京农业大学等师范类及农业类院校；以及南京医科大学、南京中医药大学等医学类高校。这些本科院校各具特色，为学子提供了丰富的教育资源和专业选择。