淮阴工学院一开始就是一所公办高校，所以不存在改公办的说法。

该校是教育部和江苏省共同建设，是经国务院学位委员会批准为服务国家特殊需求硕士专业学位研究生人才培养项目试点单位。淮阴工学院于2000年3月由原淮阴工业专科学校、淮阴工业专科学校交通分部、江苏省农垦职工大学、淮阴职工大学合并组建而成。其中，淮阴工业专科学校始建于1958年；淮阴工业专科学校交通分部源于1985年筹建的淮海交通职业专科学校；江苏省农垦职工大学始建于1964年；淮阴职工大学始建于1975年。

2011年，学校成为“服务国家特殊需求项目”硕士专业学位研究生培养单位。

2021年，经国务院学位委员会批准，学校成为硕士学位授予单位。