学校设有17个二级学院，有数学、教育学2个国家民委重点学科，中国少数民族史、中国少数民族语言文学2个国家民委重点建设学科。

现有44个本科专业、6个专科专业，专业设置涵盖经济学、法学、教育学、文学、理学、工学、管理学、艺术学等8大学科门类。 其中，数学与应用数学、学前教育2个专业为国家一流本科专业建设点，小学教育、学前教育、数学与应用数学、新闻学、翻译、数据科学与大数据技术、水质科学与技术、思想政治教育，计算机科学与技术等9个专业为自治区一流本科专业建设点。 师范类专业涵盖工学、理学、文学、艺术等学科，形成了学前教育、小学教育、中学教育、科学教育等特色鲜明的师范类本科专业体系。学校现有14门自治区级一流课程、7门自治区级精品课程、10门自治区在线开放课程。有2个自治区级实验教学示范中心，87个教学实验室、157个校外教学实习实训基地、73个校外教育见习基地、1个劳动教育基地、8个校企合作基地。呼和浩特民族学院开设的本科专业有法学、思想政治教育、学前教育、小学教育、体育教育、中国少数民族语言文学、日语、新闻学、数学与应用数学、计算机科 学与技术、信息管理与信息系统、财务管理、税收学、文化产业管理、行政管理、档案学、音乐学、播音与主持艺术、美术学、摄影、视觉传达设计、环境设计、产 品设计、服装与服饰设计、汉语言文学、英语语言文学、音乐表演、水质科学与技术等专业。