哈尔滨理工大学由原机械工业部所属的哈尔滨科学技术大学、哈尔滨电工学院和哈尔滨工业高等专科学校于1995年合并组建而成，1998年划转黑龙江省属，实行中央与地方共建、以地方为主的管理体制；

2008年，在黑龙江省高等教育强省建设规划中被确定为重点建设的十所高水平大学之一。