高本贯通和专科填报志愿在时间上可能存在冲突。

高本贯通是指高中毕业生可以通过高考成绩直接申请本科和专科学校，而专科填报志愿是指高中毕业生可以选择报考专科学校。由于两者都需要在高考后进行填报，所以在填报志愿时可能会存在时间上的冲突。因此，学生需要根据自己的情况和志愿填报规定，合理安排时间，确保能够同时参加高本贯通和专科填报志愿。