高校院长助理和副院长的区别在于职级和职责不同。

首先，院长助理行政级别相当于高校下面部门的负责人，而副院长属于院领导。其次，院长助理的职责和职权是由院长赋予的，助理对外的行为必须以院长的名义做出。而副院长的职责和职权来自于组织和法律的授权，他可以以自己的名义对外行史职权。