区别就是录取顺序上的不同。

两者的毕业证都是国家承认的专科学历，本质上是没有区别。专科(高职高专)一批指公办本科院校（不含独立学院、民办高校）的专科（高职）班及省部属的普通高等专科学校、职业技术学院，所有高校的艺术类、体育类专科专业以及其他经教育部批准在专科一批招生的专业。专科(高职高专)二批指市属职业技术学院的专科（高职），独立学院的专科（高职），民办高校的专科（高职），部分院校中外合作办学专科（高职），独立设置成人高校专科（高职），分校办学点的专科（高职）以及高等职业教育对口招生、优秀运动员、实践生专科（高职）专业。