内蒙古科技大学是由包头钢铁学院、包头医学院和包头师范学院于2003年合并组建而成的。

由于钢铁学院是由原冶金部举办，后划归内蒙古教育厅。而医学院和师范学院是包头市举办的。合并不久就因为拔款渠道不同，教师待遇不同。出现了不少问题而实质性分立，互不隶属。现在包头钢院仍称为内蒙古科技大学，而师院和医学院已恢复原称呼。