安徽省巢湖市共有两所本科院校，分别是巢湖学院和合肥师范学院滨湖校区。

其中，巢湖学院是巢湖市唯一一所全日制公办本科高校，设有15个二级学院，涵盖60个本科专业，以工学、管理学、文学、理学、经济学、教育学等多学科协调发展。合肥师范学院滨湖校区则是一所具有师范特色的本科高校，同样提供多个专业供学生选择。这两所大学在各自领域内都有着较高的教学质量和学术声誉。