纳税申报方式主要有三种方式，包括自行申报（也称直接申报）、邮寄申报、数据电文申报。实行定期、定额交纳税款的纳税人可以实行简易申报、简并征期等申报纳税方式。
其中，自行申报指纳税人和扣缴义务人在纳税申报期限内,自行直接到主管税务机关办理纳税申报手续。这是目前最主要的纳税申报方式。邮寄申报通过邮政部门办理交寄手续,以邮政部门收据作为申报凭据的方式。这种申报方式比较适宜边远地区的纳税人。数据电文是以税务机关确定的电话语音、电子数据交换和网络传输等电子方式进行纳税申报。要求保存纸质申报资料，并定期报送主管税务机关。