涉农企业所得税优惠的注意事项主要在于对优惠享受情形的确认，根据《中华人民共和国企业所得税法实施条例》的第八十六条规定，企业从事以下项目的所得免征企业所得税：
1、蔬菜、谷物、薯类、油料、豆类、棉花、麻类、糖料、水果、坚果的种植；
2、农作物新品种的选育；
3、中药材的种植；
4、林木的培育和种植；
5、牲畜、家禽的饲养；
6、林产品的采集；
7、灌溉、农产品初加工、兽医、农技推广、农机作业和维修等农、林、牧、渔服务业项目；
8、远洋捕捞。
企业从事下列项目的所得，减半征收企业所得税：
1、花卉、茶以及其他饮料作物和香料作物的种植；
2、海水养殖、内陆养殖。