金税三期是一项国家级税收管理的信息系统工程，是国家电子政务建设的重要组成部分。金税三期系统融合了税收征管变革和技术创新，统一了全国国地税征管应用系统版本，搭建了统一的纳税服务平台，实现了全国税收数据大集中，对于进一步规范全国税收执法、优化纳税服务、实现“降低税务机关征纳成本和执法风险，提高纳税人遵从度和满意度”的“两提高、两降低”的税收征管改革目标具有极其重要的意义。
金税三期系统的应用，提高了查处企业违规风险水平的效率，由于金税三期系统不断进行更新，过去企业的舞弊方法不再起作用，违规操作的企业会成为税务预警的对象。