企业补缴个税通过“应付职工薪酬”科目核算，补缴时根据员工部门计入对应会计科目，个税随下次发放工资时做扣除，具体账务处理如下：
1、计提工资时：
借：管理费用等
贷：应付职工薪酬——工资
2、发放工资时：
借：应付职工薪酬——工资
贷：银行存款
应交税费——应交个人所得税
3、个税申报扣除时：
借：应交税费——应交个人所得税
贷：银行存款
4、根据《中华人民共和国税收征收管理法》第三十二条规定，纳税人未按照规定期限缴纳税款的，扣缴义务人未按照规定期限解缴税款的，税务机关除责令限期缴纳外，从滞纳税款之日起，按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。对于补缴个税产生滞纳金的情况，账务处理如下：
借：应交税费——个人所得税
营业外支出——滞纳金
贷：银行存款