1、产出环境不同淡水珍珠和海水贝母珍珠的生长环境是不同的，海水贝母珍珠一般产自热带或亚热带的浅海中，淡水珍珠则主要是江、河中产出的珍珠。

2、形状不同淡水珍珠属于无核养殖，其外形丰富多样化，常见的有扁圆形、椭圆形、近圆形、异形等，正圆形的比较少见，而海水贝母珍珠属于有核养殖，一般是正圆形居多。

3、光泽不同淡水珍珠的主要成分是珍珠质，表面呈现的是金属光泽，而海水贝母珍珠的珍珠质是覆盖在表面上的，其光泽度要比淡水珍珠更加强烈一些，而淡水珍珠显得柔和一点。

4、产量不同海水贝母珍珠的产量很低，一般平均三只贝才可产一粒海水珍珠，淡水珍珠的产量比较高，平均每一贝可产淡水珍珠6-8粒。

5、价格不同由于产量稀少、外观光泽度更好等原因，海水贝母珍珠的价格比淡水珍珠的价格相对高得多。