东南大学辅修报名需要先登录教务系统，进入选课页面选择对应的辅修课程，填写个人信息并上传相关证明材料，最后进行在线缴费。

需要注意的是，辅修课程的选课时间和主修课程的选课时间可能不同，需要及时关注通知和时间表。同时，辅修课程的学分不计入主修课程的学分，但可以作为课外学习和拓展专业知识的一种方式。