马克笔的笔头有粗、软、细之分，一般粗头就是硬头，比较适合用来表现体积、空间感的物品或者空间，适合室内设计、产品设计等；软头笔的笔头弹性多变，可以画出细或粗的线条，自然晕染也比硬头笔自然，画出的线条流产自然；细头一般是用作画细节或者勾线突出主体物的作用，在画画中恰当使用可谓是点睛之笔。

其次是马克笔的墨水也有区别。分为油性、酒精性和水性马克笔。油性马克笔耐水速干，味道小，颜色多次叠图也可，不搓泥伤纸；酒精性马克笔可以在光滑表面上书写，同时也很速干，但味道稍微难闻；水性马克笔不适合多次叠涂，会导致颜色失去原本的亮丽透明感，容易损伤纸面破坏画作。