南京公寓可以进行转让更名。

具体操作需要按照以下步骤进行：双方当事人签订转让协议，约定转让价格、交付时间、权利义务等事项；转让方提供房产证、身份证等证件及相关材料；受让方在南京房产交易中心办理过户手续，支付税费等相关费用；完成过户手续后，南京房产交易中心会重新办理房产证，更名为受让方的名字。需要注意的是，具体操作流程可能会因地区和具体情况而有所不同，建议在进行转让更名前，先了解相关规定和流程，避免出现问题。