南京理工大学研究生院包括19个学院，涵盖了工程、科学、文学、经济、管理、法学、教育等多个学科领域。

其中，工程学院、材料科学与工程学院、信息科学与技术学院、光电科学与工程学院等学院在各自领域内具有较高的学术水平和国内外影响力。此外，南京理工大学研究生院还设有博士后流动站，为博士后研究人员提供优秀的学术环境和科研平台。南京理工大学研究生院的各个学院和研究中心不断推进科学研究和人才培养，为国家和社会做出了积极贡献。