一般选择模式有：USB-HDD/USB-HDD-FAT32硬盘仿真模式:DOS启动后显示C:盘，HP U盘格式化工具制作的U盘即采用此启动模式;老毛桃U盘启动制作工具采用USB-HDD-FAT32模式;此模式兼容性很高，一般都选择此模式，但对于一些只支持USB-ZIP模式的电脑则无法启动。

USB-HDD+增强的USB-HDD模式，兼容性高于USB-HDD模式,但对仅支持USB-ZIP的电脑也无法启动。USB-ZIPUSB-ZIP（大软盘模式）： 启动后U盘的盘符是A大容量软盘仿真模式，此模式在一些比较老的电脑上是唯一可选的模式，但对大部分新电脑来说兼容性不好，FlashBoot制作的USB-ZIP启动U盘即采用此模式。USB-ZIP+增强的USB-ZIP模式，支持USB-ZIP/USB-HDD双模式启动，从而达到很高的兼容性。其缺点在于有些支持USB-HDD的电脑会将此模式的U盘认为是USB-ZIP来启动，从而导致大容量U盘的兼容性有所降低。