一、招收专业不同1、南京工业大学1104：南京工业大学1104的招收专业为常州大学普通一本专业和二本专业。

2、南京工业大学1604：南京工业大学1604的招收专业为常州大学（中外合作办学）专业。

二、毕业证书不同1、南京工业大学1104：南京工业大学1104毕业后只可以得到南京工业大学的毕业证书。

2、南京工业大学1604：南京工业大学1604毕业后既可以得到南京工业大学的毕业证书，此外还可获得对应外校的文凭，受到国家教育部认可。

三、教学课程不同1、南京工业大学1104：南京工业大学1104不会开设双语课程，由南京工业大学教师讲授专业核心课程。

2、南京工业大学1604：南京工业大学1604有海外留学背景的专业教师开设双语课程，外方学校选派优秀教师讲授专业核心课程。