华东交通大学铁道工程专业创办于1995年并开始招收专科生、1996年开始招收本科生，后整合为土木工程专业的一个方向，经历了铁道工程、交通土建工程及道路与铁道工程等专业、方向名称的变更。

2016年华东交通大学向教育部高教司提出恢复铁道工程专业的申请，自2017年开始单独招生。