厦门航空公司的航班，无论是由自己执飞，还是别的航空公司执飞（即它与别人共享航班），航班号都以MF开头，例如MF1234。

当然，如果是别的航空公司与厦航共享航班，那么那个航空公司售卖的航班将显示它自己的航班代码。例如厦航执飞的MF1234航班，如果南航与它共享了，那么南航售出的机票，航班号将会显示为CZ1234（大部分情况下，航班号数字保持一样，有时候也会改变为其他编号，例如变成CZ5678）