厦门大学和厦门理工大学在以下几个方面存在区别：

1. 学科设置与办学定位不同：厦门大学是一所综合性大学，涵盖文、理、工、管、法等多个学科领域；而厦门理工大学则更加专注于工程技术类学科。

2. 研究重点不同：厦门大学在多个学科领域，如化学、材料科学、经济管理等方面具有深厚的研究实力和学术影响力；而厦门理工大学则在工程技术类学科中有着较为突出的研究和创新成果。

3. 学校氛围和文化特点：厦门大学注重人文教育和学术传统，强调人文素养和全面发展；而厦门理工大学则更加注重工科专业技能培养和实践能力的培养。总的来说，厦门大学以全面发展和多学科实力见长，而厦门理工大学则以工程技术类学科为主要特色。