在列入的各种重点建设的大学教育工程中，中科大和北航差不多，只是相对看中科大属于“九校联盟”成员，即C9。

有人认为985相当于王冠的话，C9被认为是王冠上的明珠，中科大的声誉度更高一些。不过，中科大和北航各有所长。中科大的优势学科集中在基础学科的数学、物理学、化学、地球物理学、生物学等方面，而北航的优势是工科，尤其航天航空更为突出，其机械工程、机械电子工程、计算机科技、材料科学与工程、人机与环境工程、系统工程、测试计量技术及仪器、航空宇航制造工程、车辆工程、航空宇航推进理论与工程、飞行器设计等专业都是国家重点学科。从考生往年录取线看，中科大在大多数省市要高于北航。但考生择校，建议要根据自己的擅长学科及兴趣，按自己喜欢的专业区选择相应优势的高校。