上海大学通信工程系属于高等教育的学科专业，具体处于大学的学科结构中的哪个层次取决于学校的组织架构。

一般来说，大学的学科结构可以按照国际标准分类体系（Classification of Instructional Programs, CIP）来划分，其中通信工程通常属于工程学或者信息技术相关的领域。在大学的学科层次结构中，通信工程系可能处于工程学院、信息与电子工程学院或者计算机与软件工程学院等学院之中。因此，具体的层次可以根据上海大学的组织结构和学科设置来确定。如果您想了解更详细的信息，建议您查询上海大学的官方网站或者与该校的相关部门或学院联系。