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动物科学技术学院是吉林农业大学历史最悠久的主干院系之一，是全国首批硕士学位授权单位。学院设有动物科学、动物医学、水产养殖学、经济动物学4个系和1个专业基础教学部。有畜牧学和兽医学一级学科博士点；有畜牧学和兽医学2个博士后科研流动站；有动物营养与饲料科学、动物遗传育种与繁殖科学、特种经济动物饲养、预防兽医学、临床兽医学、基础兽医学、草学7个学术硕士学位授权学科，有畜牧、兽医和农艺与种业3个专业硕士学位授权学科；有动物科学、动物医学、水产养殖学、草业科学和野生动物与自然保护区管理5个本科专业。