两个学校的专业方向不同。

2个学校都是211、985名校。看你对什么行业感兴趣了。武理工是化工、交通、汽车3个学校合并的，所以化工材料、船舶技术、汽车三个专业方面很好，其他专业就不行了。西南交大是山海关北洋铁路官学堂一直沿袭至今的，是中国交大5校之一，铁路系统专业和土木工程专业国内领先的。哪个好要看你希望以后从事什么行业了。我是交大的，高中同学武理工的，想了解细节可追问。