中国科学院是国内自然科学研究、基础科学研究、理论研究的最高学术机构。

中国工程院是水利工程、土木工程、建筑技术等，工程科技界的最高荣誉性、咨询性学术机构。中国工程院对国家重要工程科学技术问题开展战略性研究，提供决策咨询。 中国工程院的前身是中国科学院技术科学部，成立于1994年，是国内工程技术科学的最高咨询机构（社科院和工程院都是从中科院分离出来的）。中国工程院并不像中国科学院那样有庞大的实体，而是由机关、院士大会、主席团、学部、咨询机构、附设机构组成的，它不设分院，不设研究所，没有院属大学，不培养研究生，相对于科学院来说，工程院是一个有点“虚化”的机构，工程院具有院士评审资格，由中国工程院评选的院士称为中国工程院院士，是国内工程技术领域最高学术称号。