根据我了解到的信息，河南科技大学的土木工程专业的学费相对较高，这可能是由于该专业的课程设置、教学设施和师资力量等方面需要更高的投入，从而导致学费较高。

需要指出的是，学费的多少与学校的专业设置、教学条件、师资力量等因素有关，而与学校的层次无关。因此，不能简单地将高学费与三本专业联系起来。此外，需要注意的是，学费标准并非学校随意制定，而是需要遵守相关的法律法规和政策规定，经过严格的审批和备案程序后才能实施。如果您对具体的学费标准有疑问，可以咨询学校相关部门或者官方网站以获取更准确的信息。