广东海洋大学的主校区在湖光岩东, 海滨校区在海滨大道中43号，寸金学院在湛江师范学院后面. 学校主校区位于湛江市西郊国家地质公园—湖光岩风景区旁，占地4200亩，依山面海，环境优美；同时在湛江市区拥有三个校区：霞山校区、海滨校区和寸金校区，总占地面积4800亩。

设有水产学院、农学院、工程学院、食品科技学院、经济管理学院、航海学院、信息学院、软件学院、理学院、文学院、法学院、中歌艺术学院、外国语学院、政治与行政学院、继续教育学院、职业技术学院、寸金学院等17个二级学院和体育系。现有本科专业55个，高职高专专业29个，硕士点15个，省级扶持学科4个，广东省名牌专业2个。