选择吉林大学还是长春理工大学，需要考虑多方面因素。

首先，从历史和隶属关系的角度来看，吉林大学创办于1946年，隶属教育部，长春理工大学创办于1958年，隶属吉林省教育厅。这两所学校均为公办本科学校。其次，从排名和综合实力的角度考虑，吉林大学在软科中国大学排行榜上的排名较高，而且吉林大学是211和985高校，而长春理工大学并非211和985高校。此外，吉林大学的综合实力较强，名气更大。综上所述，吉林大学和长春理工大学各有优劣，选择哪个学校需要考虑个人需求和目标。如果注重排名和综合实力，可以考虑吉林大学；如果注重专业方向和地域因素，可以考虑长春理工大学。