主要包括四个基本层系，即指导科学、基础科学、体育运动分支科学、体育专项技术科学。

体育科学体系具有一般科学系统所具有的共同特征，这就是整体性、结构性、层次性和开放性。指导科学马克思主义哲学是体育科学的指导思想，它比自然科学、社会科学要高一个层次，处于体育科学体系的最高层次。基础科学基础科学由一些社会科学和自然科学的基础学科所构成，体育科学正是植根于这些基础科学之中。这些学科主要有教育学、社会学、伦理学、心理学、生物学、生理学、解剖学、医学、遗传学等，它们分别从属于人类科学体系中的自然科学和社会科学，又分别是体育诸多应用学科的“母体”学科，体育科学诸多学科广泛地运用这些基础学科的基本原理、知识体系和科研成果来研究体育的特殊规律。体育运动分支科学这是体育科学体系中最主要的组成部分。体育运动分支科学在学科命名上往往从属于相应的基础学科，是运用个基础学科的理论研究体育运动规律的学科，共同构成体育运动的科学基础，属于体育的专业理论范畴。体育专项技术科学体育的专项技术科学是运用基础学科和体育应用学科的一般理论解决体育运动时间中各专项运动技术、理论的教学和训练问题的学科，它们是最接近于体育实践的一个层次。