手性分子，是化学中结构上镜像对称而又不能完全重合的分子。

碳原子在形成有机分子的时候；4个原子或基团可以通过4根共价键形成三维的空间结构。由于相连的原子或基团不同，它会形成两种分子结构。这两种分子拥有完全一样的物理、化学性质。但是从分子的组成形状来看，它们依然是两种分子。这种情形像是镜子里和镜子外的物体那样，看上去互为对应。由于是三维结构，它们不管怎样旋转都不会重合，就像左手和右手那样，称这两种分子具有手性，又叫手性分子。 因此这两种分子互为同分异构体，这种异构的形式成为手性异构，有R型和S型两类。【简而言之，就是一个碳原子上连了四个不同的基团或原子，那么这个碳就是手性碳，该分子就是手性分子。】