建筑学院最强，然后是信息科学与技术学院，还有电子科学与技术学院、土木工程学院和交通学院，专业好而且就业情况好。清一色的工科专业！还有，东南的生物医学全国第一，但是就业远远不如前面五大学院。

东南大学是一所综合性大学，拥有多个学科领域的优势。根据2021年的排名，东南大学的建筑学专业、城乡规划、风景园林、机械工程、能源与动力工程、信息工程、土木工程、工程管理、电子科学与技术、自动化和计算机科学与技术等专业都是该校的优势专业 。