南通大学的主校区叫做启秀校区，位于江苏省南通市崇川区海门西路9号，占地面积约1000亩，建筑总面积68万平方米。

该校区建筑风格别致，绿树环绕，校内设施齐全，包括图书馆、实验楼、体育馆、学生公寓、食堂、商业街等。启秀校区是南通大学最重要的一个校区，也是南通大学各院系教学、科研、管理的中心。在这里，学生们可以感受到良好的校园文化氛围，享受到完善的教学和生活设施，同时还可以参与各种形式的文化活动和社团组织，丰富自己的课余生活，为未来的发展打下坚实的基础。