一:土木工程专业。

土木工程专业为国家一级重点（培育）学科。二:水利水电工程专业。水利水电工程是国家首批211工程重点建设学科、国家一级重点学科。三:计算机科学与技术专业。计算机科学与技术专业2004年被评为江苏省省级特色专业。

2008年获批国家级特色专业。拥有一级学科博士点和博士后流动站。四:港口航道与海岸工程专业。港口航道与海岸工程本科专业为国家特色专业建设点，学院为教育部高等学校水利学科港口航道与海岸工程专业教学指导委员会组长单位。五:工程力学专业。工程力学专业是国家重点学科，有一级博士学位授权点，也是国家特色专业和江苏省品牌专业，建有国家工科基础课程（力学）教学基地、国家级力学实验教学示范中心。六:电气工程及其自动化专业。电气工程及其自动化专业为国家级特色专业，设有电气工程一级博士学位授权点，师资力量强大、硬件设施齐全。