司南导航建立坐标系的基础是地球的形状和大小，采用的是与地球表面的椭球形相吻合的WGS84坐标系。

具体建立步骤是：首先在全球范围内，使用卫星测量等手段确定大量考点的经纬度，从而形成全球坐标系。然后再根据国家和地区的实际情况，建立各个区域相对应的局部坐标系，如国家测绘地理信息局制定的2000国家大地坐标系。建立好的坐标系可以用于地图制作、定位导航等各种地理信息应用。