商家可以通过以下途径向拼多多申请补偿：首先，商家应登录拼多多商家后台，找到相应的订单并点击申请售后；然后，填写详细的补偿申请理由，并上传相关的证据材料，如照片、视频等；最后，提交申请并等待拼多多的审核，待审核通过后，商家可获得相应的补偿金额。

商家在申请补偿时应提供真实准确的信息和证据，以确保申请的合理性和有效性。