萧山农场自建房是否有房产证取决于该房屋是否已经获得了相应的权属证明。

在过去，农村自建房通常没有房产证，因为我国规定，房产买卖以办理权属转移登记为准，没有产权证的房产是不允许交易的 。然而，近年来，萧山区已经开始了农村宅基地及住房确权登记发证工作，实行“房地一体”，农村宅基地使用权及住房所有权实行统一登记，颁发统一的不动产权证书 。因此，如果你的萧山农场自建房已经完成了确权登记发证，那么它应该是有房产证的。具体的办理流程可能包括向村委会提出建房申请，经过审核同意后，再向乡乡建办提出申请，经过实地踏看和批准后，才能领取产权证 。需要注意的是，虽然现在农村自建房有了房产证，但并不意味着所有的自建房都可以办理房产证。例如，修建在农村规划范围外的房屋，或者改变原有用途的房屋，都无法办理房产证 。所以，如果你想要确保你的自建房有房产证，最好还是咨询当地的相关部门，了解清楚具体的办理流程和条件。