导航工程专业的毕业生主要从事航空、航海、卫星通信、地理信息等领域的研究、开发、生产和应用。

他们可以在国防科技、民航、航天、电信、地理信息等行业的相关企事业单位、科研院所、大专院校等领域从事导航技术、信号处理、遥感数据处理、卫星通信、地理信息系统和精密制导等方面的研究和开发工作，或者从事相关领域的管理、市场营销、技术支持等方面的工作。此外，随着物联网、自动驾驶、智能家居等新兴领域的发展，导航工程专业的毕业生也可以在这些领域找到广泛的就业机会。