如果是员工在工作的过程中和实际行为造成的失误，给公司导致亏损的话，那么公司是可以让员工进行赔偿的，或者可以按照劳动合同的约定，让员工进行相应经济赔偿。

赔偿的话，可以从员工工资上面扣除，或者要求员工支付相应的赔偿金。可以这么做。