一般草缸的底沙是不用清理的（1）过滤桶或过滤器24小时常开即可保持水质；（2）草缸稳定下来后，鱼的粪便会先经有益菌分解，而后又被植物吸收，悬浮物会被过滤器抽走；草缸内水需要常换，有些污垢是溶解在水中的无法过滤；（3）使用水草泥的草缸，缸底不能翻，会加速水草泥的粉化；（4）使用陶粒等的草缸，可以用洗沙器，不建议电动洗沙器（水回流到缸中对整理水质影响很大，容易死鱼）；每次只能洗一小部分，但即使是这样缸内水质还是容易崩，因为破坏了整体菌群的稳定，鱼类易收到影响，严重会死亡。

（5）可以在缸内空白处都中上草坪，就不用纠结粪便的问题了。

（6）如果底沙不种草的话，一是底沙铺得不要厚，二是养一些鼠鱼在缸内，随时翻砂，污垢积不下来。