水中的氮的去除更适宜采用生物方法，因为氮在水中的形式有很多，比如氨氮、铵盐、硝酸根、亚硝酸根等，不是简单的投加药剂就能完全去除的，水中的反硝化细菌去除水体中多余的氮，少数反硝化细菌为自养菌，如脱氮硫杆菌，它们氧化硫或硝酸盐获得能量，同化二氧化碳，以硝酸盐为呼吸作用的最终电子受体。