选择初中生物显微镜的镜筒时，主要考虑两个因素：放大倍率和目镜舒适度。

首先，根据实验需求选择合适的放大倍率。通常，低倍镜（如4X或10X）用于观察整体结构，而高倍镜（如40X或60X）用于观察细节。其次，确保目镜舒适且易于观察。目镜通常有不同长度和眼距，以适应不同用户的眼睛和头型。建议亲自尝试多种目镜，找到最适合自己的那一款。最后，确保镜筒与显微镜的其他部件兼容，以便获得最佳成像效果。