新组建的南通大学选址啬园路，建成学校建设与发展的核心区域，是本科生、研究生教育的主要基地，科技创新与社会服务的主体功能区，对外合作与开放交流的窗口，内部治理的行政中枢。

主校区以张謇号“啬”字命名，旨在秉承先校长提出的“祈通中西 力求精进”的校训精神和“学必期于用 用必适于地”“道德优美 学术纯粹”的办学理念，体现学校文化特色，彰显学校精神和文化积淀。啬园校区占地129公顷，校区规划目标是建设成为21世纪具有江南水乡特色的一流大学校园，实现环境生态化、景观园林化、校园人文化。